1. 性染色体遗传模式的限制
X和Y染色体的传递特点：雄性（XY）只能将X染色体传给雌性后代，Y染色体传给雄性后代。由于Y染色体在进化中重组受限，其携带的基因多样性较低，导致雄性在后代性染色体多样性贡献上存在不对称性。
线粒体DNA的母系遗传：线粒体DNA仅通过雌性传递，雌性个体的繁殖行为直接影响线粒体基因库的多样性。若雌性数量少或繁殖受限，可能导致线粒体多样性降低。
2. 性别比例对种群遗传多样性的影响
有效种群大小（Ne）：性别比例失衡（如雄性过少）会降低有效种群大小，增加近交风险，从而减少整体遗传多样性。例如，若印尼某些岛屿的猫种群因人为因素（如选择性捕杀）导致雄性减少，可能加速遗传漂变。
交配策略：猫科动物通常为多配偶制，优势雄性的繁殖垄断可能减少基因库的多样性。例如，若某地区一只雄性猫与多个雌配，其后代会携带相似父系基因，降低种群多样性。
3. 性别相关的扩散行为
雄性的扩散倾向：研究表明，雄性猫倾向于长距离扩散以占领新领地或寻找配偶，这种行为可能促进不同种群间的基因流动，从而增加遗传多样性。例如，印尼群岛的地理隔离可能因雄性的跨岛屿迁移而缓解，减少近交衰退。
雌性的定居性：雌性通常留在出生地附近，若种群孤立（如岛屿环境），可能导致局部基因池的同质化，需依赖雄性迁入带来新等位基因。
4. 环境与人为因素的交互作用
岛屿效应：印尼由众多岛屿组成，地理隔离可能导致种群分化。雄性的迁移能力可能成为连接不同岛屿种群的关键，维持区域遗传多样性。
人类干预：家猫与野猫的混交、宠物贸易引入外来基因等，可能通过性别差异的繁殖行为（如流浪雄猫更广泛交配）加速基因混合或稀释本地基因型。
5. 保护生物学意义
性别平衡管理：在保育项目中，维持健康的性别比例可有效提升种群适应性。例如，印尼的猫保护计划可能需要监测雄性扩散路径，确保基因交流。
避免奠基者效应：引入新个体时需均衡性别，防止单一性别主导繁殖，尤其是在小型岛屿种群中。
印度尼西亚猫的性别通过性染色体传递模式、扩散行为及繁殖策略，显著影响遗传多样性。雄性的迁移能力和交配范围可能对打破地理隔离、增加基因流动起关键作用，而雌性的线粒体遗传和定居性则影响局部基因库的稳定性。保护实践中需结合性别差异制定策略，以维持种群健康与进化潜力。未来研究需针对印尼本地猫种群开展基因测序，进一步验证性别与多样性的具体关联。
