1. 引入遗传多样性并促进品种形成
印度尼西亚的猫种群在历史上为现代家猫品种的形成提供了遗传基础。例如，阿比西尼亚猫的起源可能与印度尼西亚群岛有关，荷兰商人可能从当地港口（如爪哇岛）引入具有独特基因的猫种，这些猫携带了长毛基因等特征，为后续品种（如索马里猫）的形成奠定了基础。这种基因流动丰富了家猫的遗传多样性，并通过杂交策略引入了新的表型特征。
2. 实践和应用遗传学理论
印尼猫的繁殖技术为动物遗传学中的繁殖策略提供了实践案例。例如，通过线繁殖（同一品种不同血统的繁殖）和远亲繁殖（不同特征个体的杂交），印尼当地的猫种可能帮助维持遗传平衡，减少近亲繁殖系数（COI），从而降低隐性遗传疾病的风险。这些策略在遗传学研究中被证明是维持健康种群的关键。
3. 支持遗传学研究的样本来源
印尼的猫种群为全球猫科动物遗传研究提供了重要样本。例如，巽他古地（包括印尼群岛）的猫猴新物种发现表明，该地区的生物多样性研究对理解物种分化和基因交流具有重要价值。尽管猫猴并非家猫，但其遗传研究方法（如基因测序和种群结构分析）可为家猫的遗传学研究提供参考。
4. 揭示驯化与基因交流的复杂性
印尼本地野猫与家猫的潜在基因交流可能为驯化历史研究提供新视角。类似中国荒漠猫与家猫的基因渗透案例，印尼的野猫种群可能在家猫的适应性进化中发挥作用，例如增强抗病能力或环境适应性。这种基因交流的机制研究有助于完善家猫驯化的单起源理论。
5. 推动遗传学工具的发展
印尼猫的繁殖实践促进了近亲繁殖系数（COI）等遗传学工具的应用。通过血统分析和基因贡献计算，育种者能够更科学地评估遗传风险，避免过度近亲繁殖导致的健康问题。例如，印尼可能参与的猫种繁育项目展示了如何通过计算COI来优化繁殖策略。
印度尼西亚猫的繁殖技术通过引入遗传多样性、实践繁殖策略、提供研究样本及推动遗传学工具发展，对动物遗传学产生了多维度贡献。这些贡献不仅限于家猫品种的形成，也为野生物种的遗传研究提供了方法论和实证案例。
